این روزنامه‌نگار چندین بار از اوایل دهه هشتاد، همزمان با اولین توقیف روزنامه آسیا به دلایل مختلف مورد بازجویی ماموران امنیتی قرار گرفته است.

جمشیدی، آبان ماه 1391 در پی یک تماس تلفنی به وزارت اطلاعات احضار شد.

وی در این باره به «خبرنگاری جرم نیست»، گفت: «در این بازجویی که هفت ساعت به طول انجامید، ماموران سوالات مختلفی را از زندگی شخصی، کاری و ارتباطات من مطرح و در انتها با نشان دادن برگه مکتوبی عنوان کردند که می‌توانستند مرا بازداشت کنند اما ترجیح دادند این کار را انجام ندهند.»

علت بازجویی رسما به وی اعلام نشد اما انتشار یادداشتی در ارتباط با «عبدالرحیم جعفری»، بنیان‌‍‌گذار انتشارات غصب شده «امیر کبیر»، به مناسبت تولدش یکی از محورهای سوالات بازجویان بود.

پس از بازداشت «ایرج جمشیدی» در اردیبهشت 1396، نوید جمشیدی، فرزندش با انتشار یاداشت‌هایی در ارتباط بازداشت مشکوک پدر و مطالبی راجع به تخلفات بانک ملت، که به ظاهر شاکی پرونده ایرج جمشیدی بود به دادسرای فرهنگ و رسانه(میدان ارگ) احضار شد.

نوید جمشیدی در این باره گفت: «پس از چندین بار احضار به دادسرا، سرانجام پرونده من برای محاکمه به دادگاه مطبوعات (سالن ولایت) ارجاع داده شد و در بهمن ماه 1396 با رای قاضی "کشکولی" به پرداخت یک میلیون و پانصد هزار تومان جریمه محکوم شدم. دادگاه تجدیدنظر با توجه به اینکه من سوء سابقه‌ای نداشتم، از اتهام «نشر اکاذیب»  و «تشویش اذهان عمومی» تبرئه‌ام کرد.»

جمشیدی در حال حاضر سردبیر بخش آنلاین روزنامه آسیا است و در سال‌های اخیر چندین بار به خاطر مصاحبه‌هایش با رسانه های فارسی زبان خارج از کشور توسط افراد ناشناس تهدید شده است.