یوسف عمادی روز 13 مهر ماه 1392 در ساری به همراه حسین و مهدی رجبیان به دلیل بارگذاری موسیقی زیرزمینی در سایت «برگ موزیک» در محل کار و استدیوشان بازداشت شدند.

«برگ موزیک» از سال 1387 تا 1392 به پخش موسیقی زیر زمینی ایران پرداخت و خود را «بنیان رسمی گزارش موسیقی» معرفی کرده بود و یوسف عمادی در زمان بازداشت مسئولیت فروش سی‌دی‌های سایت برگ موزیک را برعهده داشت.

این سه هنرمند پس از بیش از دو ماه حبس و بازجویی در بند اختصاصی اطلاعات سپاه در زندان اوین(بند دو-الف) با قرار وثیقه 200 میلیون تومانی آزاد شدند.

یوسف به همراه دو هنرمند دیگر در مهر ماه ۱۳۹۴ از سوی شعبه ۲۸ دادگاه انقلاب به ریاست قاضی مقیسه هر کدام به ۶ سال حبس تعزیری و جریمه نقدی محکوم شدند.

اتهام این سه هنرمند «فعالیت تبلیغی علیه نظام» و «توهین به مقدسات» عنوان شده بود.

این حکم در دادگاه تجدیدنظر که در شعبه ۵۴ دادگاه تجدید نظر استان تهران در روز اول دی ماه 1394 برگزار شد به ۳ سال حبس تعزیری، سه سال حبس تعلیقی و پرداخت ۲۰ میلیون تومان جریمه نقدی کاهش یافت.

روز 16 خرداد ماه ۱۳۹۵، یوسف به همراه برادران رجبیان خود را برای تحمل دوره محکومیت به زندان اوین معرفی کرده بودند.

در بیانیه‌ای که روز چهارم تیر ماه 1395 از سوی دفتر کمیسر عالی حقوق بشر سازمان ملل متحد صادر شد، «کریمه بنون»، گزارشگر ویژه سازمان ملل متحد در حقوق فرهنگی و «دیوید کی»، گزارشگر ویژه در آزادی بیان، خواستار آزادی این سه هنرمند شدند. 

آقای عمادی درحالی که در حبس بود در نامه ای که 13 دی ماه 1395 در «هرانا» منتشر شد، از هنرمدان خواسته بود که مقابل توقیف آثار هنری سکوت نکند: «آری دوستان هنرمند من، اینجا اوین است، و ما هیچ نگفتیم و ننمودیم جز این که از عقایدمان گفتیم. ما سه تن از آغاز با هم جهیدیم و به سوی آسمان پرواز نمودیم بی آنکه بدانیم کمی بالاتر از زمین دست غارتگر صیاد عقاید و افکار ما را آخر به صید خواهد کشاند. بدین وسیله از تمامی هنرمندان خواستارم که به توقیف آثار هنری واکنش نشان داده و اینگونه از پایمال شدن حقوق مؤلف جلوگیری نموده و به آن اعتراض نمایند.»

در روز 11 اسفند ماه 1395 یوسف عمادی به بند 350 زندان اوین منتقل شد.

خرداد ماه 1396 در حالی که عمادی در زندان به سر می برد به دلیل آنچه همکاری با رسانه ها اعلام شد از سوی شعبه دوم بازپرسی به «تبلیغ علیه نظام» متهم شد. این پرونده توسط اطلاعات سپاه پاسداران به اتهام «ارتباط و گفتگو با رسانه ها» از درون زندان ایجاد شده بود.

مسئولان زندان روز 13 خرداد ماه 1396 نیز این هنرمند را از بند 350 زندان اوین به یکی از اندرزگاه های اوین منتقل کردند و پس از آن محدودیت های بسیاری بر وی تحمیل شد.
لازم به ذکر است برادران رجبیان خرداد ماه 1396 از زندان آزاد شدند.

پرونده جدید یوسف عمادی روز 29 مرداد ماه 1396 در شعبه 28 دادگاه انقلاب بررسی شد و روز 21 شهریور ماه این شعبه به ریاست قاضی مقیسه از بابت اتهام تبلیغ علیه نظام این هنرمند را به یک سال حبس تعزیری و دو سال تبعید به شهر بوشهر محکوم کرد.

عمادی روز 23 تیر ماه 1397 پس از پایان دو دوره محکومیت از زندان آزاد شد.